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國立陽明交通大學牙醫學系
國際臨床數位牙醫教學與示範中心

口腔癌精準醫療

採樣Sampling

         採樣是整個流程的第一步,檢體收集和當下保存步驟的扎實執行,將直接影響後續數據品質及未來資料庫的可信度。在口腔癌檢體的收集上,執行人員主要為牙醫師或醫師,他們會藉由專業訓練判斷手術範圍並取出檢體。此時,牙醫師或醫療專業人員需要根據不同的次世代基因定序服務需求,採取不同的採樣處理方法。
 
         為保持檢體的完整性,採樣操作需在冰上進行,並將檢體切碎成約0.5 cm x 0.5 cm x 0.5 cm的小塊。之後,迅速使用液態氮冷凍,並將其放入冷凍管中進行低溫保存(液態氮或-80℃)。如果要進行轉錄體定序(RNA Sequencing;RNAseq),由於定序目標是檢體的核糖核酸(Ribonucleic Acid;RNA),因此採樣操作也需在冰上進行,並避免檢體凍融。將檢體切碎後,放置於預先冷卻的RNA保存液(或稱RNAlater)中,根據保存液說明書逐步冷凍,並保存於-20℃。採樣出的組織需在離開活體後30分鐘內立即放入液態氮或RNA保存液中。後續在檢體移動或運送時,必須以低溫乾冰方式運送(參考國家級人體生物資料庫整合平台標準作業流程)。
 
         在檢體收集的過程中,執行人員必須了解如何保持檢體的完整性,如何協助牙醫師或醫師迅速處理檢體,並確保這一過程不影響整體手術流程。
 
         除了檢體採樣,檢體的臨床資料也會按照正常程序由各醫院流程及牙醫師或醫師判讀來記錄。這些臨床資料包括病人基本資料、癌組織診斷及醫學影像等數據,將輔助牙醫師提供後續對病人的醫療服務。
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